Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERBB3P21860 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERBB3P21860 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms