Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDSP20132 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDSP20132 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDSP20132 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDSP20132 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDSP20132 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDSP20132 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDSP20132 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDSP20132 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDSP20132 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDSP20132 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SDSP20132 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDSP20132 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDSP20132 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDSP20132 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDSP20132 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDSP20132 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SDSP20132 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDSP20132 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDSP20132 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms