Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6P18850 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6P18850 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6P18850 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6P18850 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6P18850 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6P18850 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6P18850 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6P18850 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms