Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms