Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACADSP16219 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACADSP16219 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSP16219 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSP16219 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSP16219 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms