Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRAP11474 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms