Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2P10911 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2P10911 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2P10911 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2P10911 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2P10911 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms