Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms