Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD2P0DJD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD2P0DJD1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms