Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPRP00739 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPRP00739 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPRP00739 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPRP00739 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPRP00739 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPRP00739 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPRP00739 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPRP00739 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPRP00739 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPRP00739 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPRP00739 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms