Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EGFRP00533 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EGFRP00533 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EGFRP00533 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EGFRP00533 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EGFRP00533 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EGFRP00533 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EGFRP00533 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EGFRP00533 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EGFRP00533 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EGFRP00533 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EGFRP00533 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms