Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX11BO96011 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms