Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYF2O95926 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYF2O95926 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYF2O95926 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYF2O95926 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYF2O95926 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYF2O95926 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYF2O95926 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYF2O95926 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms