Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF12O95522 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms