Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPBO95292 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPBO95292 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAPBO95292 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAPBO95292 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAPBO95292 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPBO95292 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPBO95292 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms