Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOL3O95236 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOL3O95236 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOL3O95236 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOL3O95236 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOL3O95236 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL3O95236 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL3O95236 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms