Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF9O75901 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF9O75901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms