Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCEA3O75764 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEA3O75764 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms