Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRMUO75648 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRMUO75648 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRMUO75648 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMUO75648 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMUO75648 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms