Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GADD45BO75293 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GADD45BO75293 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms