Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNT1O60563 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNT1O60563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms