Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATCO43716 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATCO43716 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATCO43716 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATCO43716 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATCO43716 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATCO43716 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATCO43716 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GATCO43716 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GATCO43716 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms