Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC3O43617 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms