Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFA2T2O43439 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFA2T2O43439 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms