Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ1O43426 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ1O43426 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms