Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK2O43353 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms