Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPSS1O43252 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAPSS1O43252 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms