Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOCS1O15524 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOCS1O15524 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms