Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FANCAO15360 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
FANCAO15360 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FANCAO15360 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FANCAO15360 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FANCAO15360 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FANCAO15360 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
FANCAO15360 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FANCAO15360 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FANCAO15360 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FANCAO15360 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FANCAO15360 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FANCAO15360 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCAO15360 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FANCAO15360 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
FANCAO15360 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FANCAO15360 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FANCAO15360 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FANCAO15360 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms