Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLGNO14967 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLGNO14967 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLGNO14967 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms