Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASKO14936 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CASKO14936 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASKO14936 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASKO14936 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CASKO14936 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CASKO14936 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASKO14936 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASKO14936 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms