Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms