Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHOX2AO14813 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms