Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAFD1O14545 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAFD1O14545 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAFD1O14545 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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