Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFIBO00712 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIBO00712 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIBO00712 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIBO00712 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIBO00712 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms