Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXLO00592 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXLO00592 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXLO00592 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXLO00592 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms