Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QQQ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QQQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QQQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QQQ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QQQ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QQQ9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QQQ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QQQ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QQQ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QQQ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms