Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC188H7C350 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 427.7 ms