Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms