Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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