Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP17L23D6RBM5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms