Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8AA7E2F4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8AA7E2F4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8AA7E2F4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms