Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP73A6NFT4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms