Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNDIG1LA6NDD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms