Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3AA6NCI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms