Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms