Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCHNA4D1U4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms