Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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TCRBV7S3A2A0A539 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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TCRBV7S3A2A0A539 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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