Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms