Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC22A13-201ENST00000311856 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 POU5F1-206ENST00000513407 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KY-201ENST00000423778 2345 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PRKAG2-201ENST00000287878 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC24A1-202ENST00000339868 5678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HSD3B1-201ENST00000369413 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CASP7-212ENST00000621607 2378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PHC1P1-201ENST00000554937 3061 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC104024.2-201ENST00000562897 3077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 BTN2A1-207ENST00000541522 2845 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC027045.3-201ENST00000635215 2884 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TCP10L-201ENST00000300258 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CD300LF-203ENST00000343125 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 BRINP1-201ENST00000265922 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 C1GALT1C1-201ENST00000304661 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LSAMPQ13449 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LSAMPQ13449 AC008694.1-201ENST00000522076 428 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MDH1B-201ENST00000374412 2553 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LSAMPQ13449 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DNAJB13-205ENST00000543947 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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LSAMPQ13449 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RBMY1F-202ENST00000454978 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KIRREL3-201ENST00000525144 3808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FAM153A-223ENST00000614127 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC091167.8-201ENST00000641199 3441 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PDYN-201ENST00000217305 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 BAGE2-203ENST00000496773 2598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CLDN10-203ENST00000376873 2656 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FLRT1-201ENST00000246841 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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